Η Π.Α.Ε. Χανιά είναι επαγγελματική ποδοσφαιρική ομάδα που εδρεύει στην Κίσσαμο του νομού Χανίων της νήσου Κρήτης, στην Ελλάδα. Δημιουργήθηκε το 2017 από την συγχώνευση του Κισσαμικού με τον Α.Ο. Χανιά.